А.В. Рогов, Б.Л. Григоренко, А.В. Боченкова, А.А. Грановский, А.В. Немухин

Роль магния в реакции гидролиза трифосфатов в воде: моделирование методами квантовой и молекулярной механики

Описано моделирование механизма реакции гидролиза депротонированного эфира метил-трифосфата (MTP) до метилдифосфата (MDP) и неорганического фосфата (Pi) в водных кластерах в присутствии и в отсутствие катиона магния. Использован вариант метода квантовой и молекулярной механики на основе теории потенциалов эффективных фрагментов. При расчетах энергии и ее производных в квантовой подсистеме, включающей MTP, реакционные молекулы воды и Mg²⁺, применена теория функционала плотности (B3LYP), а взаимодействие молекул воды описано модельным потенциалом TIP3P. Показано, что энергетический профиль пути минимальной энергии для реакции MTP + H₂O ® MDP + Pi согласуется с двухстадийным процессом диссоциативного типа в отсутствие Mg²⁺и с одностадийным механизмом – в присутствии Mg²⁺.

  Полный текст статьи в формате PDF

Вестник Московского Университета.
Химия 2007, том 48, № 3, стр. 152-156