ChemNet
 
Предыдущий реферат Следующий реферат Содержание номера статья
13.МБ.101. Молекулярно-динамическое исследование бактериородопсина в пурпурной мембране Molecular dynamics study of bacteriorhodopsin and the purple membrane. Baudry Jerome, Tajkhorshid Emad, Molnar Ferenc, Phillips James, Schulten Klaus. J. Phys. Chem. B. 2001. 105, 5, с. 905918. Англ.
Метод компьютерного моделирования сверхбыстрых молек. движений в молекуле бактериородопсина (БР) с использованием данных кристаллографич. исследования БР и его фотоинтермедиатов позволил не только локализовать молекулы воды в структуре данного мембранного белка, но и проследить их движение в ходе фотоцикла (в варианте теории возмущений свободной энергии, [Roux B. et al. Byophys J. 1996, V. 71, P. 670]). Действительно, после изомеризации остатка ретиналя "полностью транс 13-цис" происходит замещение молекул воды БР важнейшая стадия механизма действия "протонной помпы". Проведено интегрирование структур БР в общую модель пурпурной МБ: в результате получена модель процесса, связывающая внеклеточные молекулы воды с ее молекулами и ключевыми функциональными группами во внутримолек. полости БР: она позволяет полностью описать движение протона в процессе фотоцикла из внутри- во внемембранное пространство.

Ключевые слова: акк бактериородопсин% акк мембраны биологические% н пурпурные% акк вода% н локализация% акк фотоцикл% к молекулярное движение% акк протоны% н передвижение из МБ во внемембранное пространство% акк модели% н МБ и белка% акк молекулярной динамики метод




Сервер создается при поддержке Российского фонда фундаментальных исследований
Не разрешается  копирование материалов и размещение на других Web-сайтах
Вебдизайн: Copyright (C) И. Миняйлова и В. Миняйлов
Copyright (C) Химический факультет МГУ
Написать письмо редактору